Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms