Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Capn12Q9ER56 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms