Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms