Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tspan4Q9DCK3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tspan4Q9DCK3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tspan4Q9DCK3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms