Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdzd9Q9D9M4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdzd9Q9D9M4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdzd9Q9D9M4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdzd9Q9D9M4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdzd9Q9D9M4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdzd9Q9D9M4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms