Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx5Q9D8U8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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