Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms