Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms