Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms