Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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