Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms