Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9CRC3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms