Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Smim8Q9CQQ0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms