Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms