Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms