Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Chmp3Q9CQ10 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Chmp3Q9CQ10 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Chmp3Q9CQ10 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms