Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms