Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms