Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Rcbtb2Q99LJ7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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Rcbtb2Q99LJ7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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