Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2aQ99KJ0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms