Protein–RNA interactions for Protein: Q99J64

Rbm43, RNA-binding protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm43Q99J64 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rbm43Q99J64 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rbm43Q99J64 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rbm43Q99J64 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rbm43Q99J64 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rbm43Q99J64 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rbm43Q99J64 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rbm43Q99J64 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rbm43Q99J64 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rbm43Q99J64 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm43Q99J64 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rbm43Q99J64 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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