Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ctu1Q99J10 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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