Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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