Protein–RNA interactions for Protein: Q91XS1

Mtmr4, Myotubularin-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr4Q91XS1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtmr4Q91XS1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtmr4Q91XS1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms