Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Stx18Q8VDS8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Stx18Q8VDS8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Stx18Q8VDS8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx18Q8VDS8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms