Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8VDP2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8VDP2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8VDP2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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