Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Med17Q8VCD5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Med17Q8VCD5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Med17Q8VCD5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med17Q8VCD5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med17Q8VCD5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med17Q8VCD5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med17Q8VCD5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med17Q8VCD5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Med17Q8VCD5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms