Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms