Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ssh3Q8K330 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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