Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Prpf39Q8K2Z2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Prpf39Q8K2Z2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Prpf39Q8K2Z2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Prpf39Q8K2Z2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Prpf39Q8K2Z2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Prpf39Q8K2Z2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Prpf39Q8K2Z2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Prpf39Q8K2Z2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Prpf39Q8K2Z2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Prpf39Q8K2Z2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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