Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nek9Q8K1R7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nek9Q8K1R7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nek9Q8K1R7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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