Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh13Q8CEE7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh13Q8CEE7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms