Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms