Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms