Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms