Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms