Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclre1bQ8C7W7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms