Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifi27Q8C6G0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifi27Q8C6G0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms