Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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