Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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