Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc12Q8BW49 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms