Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssc5dQ8BV57 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ssc5dQ8BV57 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssc5dQ8BV57 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssc5dQ8BV57 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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