Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hirip3Q8BLH7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hirip3Q8BLH7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms