Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms