Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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