Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms