Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ttc28Q80XJ3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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