Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc1Q80VQ1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc1Q80VQ1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms