Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms