Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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